Hiệp hội Nữ doanh nhân Việt Nam có Ban Thường trực, Ban Thường vụ, Ban Chấp hành, Ban Kiểm tra, Văn phòng và Ban chuyên môn
Ban Thường trực gồm 08 chị (01 Chủ tịch, 07 Phó Chủ tịch)
Ban Thường vụ gồm 24 chị
Ban Chấp hành gồm 52 chị
Ban Kiểm tra gồm 03 chị
Ban Chuyên môn: Ban Tài chính, Ban Hội viên, Ban dịch vụ hỗ trợ phát triển kinh doanh, Ban Đào tạo, Ban Đối ngoại, Ban Luật pháp - chính sách, Ban Truyền thông, Ban Xã hội - cộng đồng,
Văn phòng Hiệp hội